«Военно-морская история Азовского моря. Ч. 4 Екатерининский период»
10 ноября 1769 г. вице-адмирал А. Н. Сенявин был назначен главным руководителем по восстановлению таганрогской гавани, крепости и Азовского флота. В Указе императрицы предписывалось: «Таганрогскую гавань поставить в такое состояние, чтобы она могла служить как убежищем судам, так и для построения оных». Этим же указом предлагалось «в Троицкой крепости, что на Таганроге, построить для поклажи флотских припасов и провианта магазины и погреба, и для квартирования в зимнее время морским служителям светлицы».
Для восстановительных работ в Таганрогской гавани назначался инженер-полковник Збродов, а для постройки магазинов, светлиц, погребов, крепостных сооружений - архитектор Петров. При восстановлении гавани и крепости широко применялся опыт, приобретенный в период первоначального строительства Таганрога в петровское время. Гавань и крепость возводились на старом месте с использованием сохранившейся части петровских сооружений.
По мере развития города и гавани возрастала потребность в людях, близко знакомых с морским и торговым делом. В Таганрог и Приазовье переселяли купцов, мастеров, казаков, украинцев, крымских армян, разрешили селиться грекам и албанцам.
В результате за крепостной оградой появились купеческий форштадт и слободы казачьего полка. Связь с ними осуществлялась через Архангельские и Никольские ворота.
К весне 1771 г. первые суда Азовского военно-морского флота были готовы. 17 мая произошел торжественный акт поднятия вице-адмиральского флага на флагманском корабле «Хотин», символизировавший возрождение русского военного флота на Азовском море.
В 1771 г. началась засадка Дубовой рощи. Во второй половине 1770-х годов началось строительство новых храмов: гарнизонная Архангело-Михайловская церковь и церковь во имя св. Николая Чудотворца, покровителя моряков. В 1777 г. в Таганроге появляются первые предприятия: канатный завод и парусная фабрика. Предпринимателем Ф. К. Фурсовым начато строительство кораблей. Начинает развиваться торговля через Таганрогский порт. В связи с этим в 1776 г. в Таганроге был учрежден Главный порт Азовского моря и Главная таможня.
Екатерина II писала Вольтеру: «Я исполнила два новых предприятия: построила Азов и Таганрог, при котором Петр I основал и разорил корабельную пристань. Эти два драгоценные камня получили такую оправу, которая, может быть, не понравится Мустафе III».
Во времена Екатерины II с Таганрогом связаны имена таких известных исторических деятелей как Ф. А. Клокачев и Ф. Ф. Ушаков. В 1771 г. в гостях у родных в Таганроге побывал Емельян Пугачев.
Вскоре после присоединения Крыма и основания Севастополя военное значение Таганрога начинает падать. 10 февраля 1784 г. вышел в свет «Именной указ об устройстве новых укреплений по границам Екатеринославской губернии». Среди многих положений Указа значится следующее: «…остающиеся внутри пределов Государства город Таганрог, крепость Святыя Елизаветы и прочия, по старой и по новой линии лежания, отныне крепостями не почитать». На Таганрог больше не возлагали полномочия южного морского форпоста Российской империи. Крепость вместе с гарнизоном в Таганроге упразднялась. Азовская флотилия перебазировалась в Крым, в Ахтиярскую бухту.
Таганрог далее развивался как важнейший внешнеторговый порт южной России.